元和五年至六年这两年期间，对德川将军宗家而言最为重要的战略，就是与天皇的结亲了。
在完成幕藩体制整顿后，秀忠决定遵从父亲家康生前“与天皇家结亲”的心愿，让德川氏血脉渗透进天皇一族，继而为幕府的长治永续奠定不二基石。
早在庆长十六年（公元1611年）后水尾天皇即位当年，家康就开始布局推动将秀忠五女和姬嫁入皇宫的规划，并向皇室提交了申请。
庆长十九年（公元1614年），在家康的软硬兼施下，朝廷终于在四月发出让和姬入宫的宣旨。
但由于横亘两年的大坂冬、夏之阵，以及元和二年（公元1616年）家康去世、元和三年后阳成天皇驾崩等系列原因，朝廷不得不推迟和姬入宫的时间。
但秀忠并未因此延缓与天皇联姻的步伐，并于元和四年下令开始建造专属于和姬的女御御殿。
不过对被施压要迎娶和姬的后水尾天皇来说，或许内心又是另一番滋味。
于是在迎娶和姬之前，他就宠信了宫中的女官与津子，并与她生下皇子贺茂宫及皇女梅宫。
这不但一度成为和姬嫁入皇家的阻碍，更被幕府认为是后水尾天皇的挑衅，从而激怒了对这场公武联姻志在必得的秀忠。
此时的秀忠，已经是让满朝文武信服、天下大名无人敢于与之对抗的强权将军了。
自从秀忠正式执掌天下之后，为了更有力的统御全国诸大名，他铁腕改易了以福岛正则为代表的外样大名，并依父亲家康遗言建立了御三家。
除了福岛正则，秀忠强力改易的范畴还延伸到了幕府重臣阵营，例如下总见小川的城主安藤重信也在这场调整里，被改易为上野高崎城主。
不过在领地改易过程里，也有超乎秀忠掌控范畴的意外发生。
例如正纯便以家康遗命作为借口，将奥平忠昌由10万石的下野宇都宫藩转封至11万石的下总古河藩，而自己则由5万3000石的小山转封至15万5000石的宇都宫。
既然正纯祭出家康遗命作为扩大自己领地的理由，秀忠便不好加以否定，但他也由此招致了秀忠更深的反感。
在施政革新上，他起用了土井利胜、酒井忠世等自已的班底担任幕府权利中枢的老中，逐渐架空以本多正纯为首的家康时代宠臣，继而形成了自已特色的领导风格。
竹千代在与宗矩谈及秀忠施政特点时，曾感慨：“父亲在政事领域的天赋与才能，要远胜于军事方面的作为，他是天生的内政型将军。”
在政事方面有着灵敏嗅觉、并且越来越融入幕府机制的竹千代，随着自身的越发强大，也更加能洞见到父亲在治理方面的出类拔萃。
在家康的前四个儿子里，排行老三的秀忠，在幕臣群体里被公认为相较于他的其它三个兄弟，他可谓是家康前四子里唯一性情温厚、具有文人气息的子嗣。
但正是有着此类评价的秀忠，在执掌政事后行事却极度当机立断、并且杀伐果决。
他在对亲属和家臣、甚至朝廷管制方面都相当严厉，对外贸易亦仅限于平户、长崎两地。
在家康逝世后，秀忠严格执行勒令忠辉蛰居的指令，即使茶阿局数度试图斡旋，但秀忠依然不改初衷，更多次更改忠辉的流放地点。
元和五年（公元1619年），秀忠在造访京都之前，与长子竹千代进行了一场父子间的茶叙。
这场茶叙在秀忠起居的中奥进行。
此时的他在处理朝廷事务上遇到了两大难题，而竹千代在幕府的影响力与权势正逐渐壮大，他很想听听长子对此的建议。
“这么说来，朝廷并不欢迎和姬啊。倘若她嫁过去再受到天皇冷遇，只怕皇室继承人就会变成贺茂宫了。”
察觉到父亲的烦恼与忧虑，竹千代单刀直入地切入到主题，直接在秀忠面前将症结一举剖开。
“为父担心的就是这个。虽说天子有几个妃嫔并不罕见，但我总觉得天皇是存心向我们示威。”
秀忠思虑重重地端起茶碗，分明都已经端到唇边，最终却无心品尝，于是又随之将茶碗搁下。
“但纵然如此，父亲并没产生任何动摇，直到现在也是一心一意要促进和姬入宫是吗？”
“当然！若和姬诞下皇子，幕府会倾注所能将他扶持为下一任天皇。届时皇室将与德川家结合得更加紧密，天下也就为之越发安泰了。”
“那么，父亲就下令处置了贺茂宫、还有他的生母与律子、妹妹梅宫吧。”
“处置？”
“是的，将贺茂宫送出去给别人当养子，把与律子和梅宫都一并驱逐出皇宫。这样不但能一挫朝廷与皇室的锐气，也能在和姬入宫前为她扫平障碍。”
“但是天皇会答应么？他原本就对幕府满心抗拒，更遑论我们现在是要正式介入后宫之事。”