借助降伏九苗、收纳苗疆之恩威，刘琦尽收益州军民之心，连兵锋未到的汶山、汉嘉诸郡也传檄而定。自此以后无论是收编兵马，还是推行新政，进行得都是顺风顺水，刘焉刘璋父子数十年的统治根基也随之烟消云散、无人提及。
至建安八年初，公田制与户兵制等荆州新政已在益州各郡全面铺开，由于有荆南各郡血流遍地的前车之鉴在，益州大族不敢有所违逆，纷纷主动认购配合，而刘琦也考虑到本土实际，给予各家酌情转圜，除了那些死硬分子要坚决打击断根外，对大部分士族土地的收购和征收都留有余地，这让益州的新政推行出奇顺利，除了蔡瑁所在的东川二郡单独理政，其余新附各郡共得公田两万余顷。其中万顷设为公田出租，另万顷设为兵屯，可容纳户兵十万人。
户兵待遇优厚，故应募者甚众，择优招募之下，依旧很快募满名录，万顷屯田分置各处，十余万精兵列入军中。鉴于本地兵源充足，除各郡县看门、收税、守关的杂兵外，刘琦计划在益州建立两支强军，以为将来北进关中、西凉做准备：
以巴地三郡为主要兵源的镇巴军扩充到六万人，由镇巴校尉甘宁任统领，巴郡太守严颜任副统领，另有零陵邢道荣、孟达、严朗等人为副将，大寨设在水陆交汇、交通便利的阆中城，随时可以北进东下。
另以成都所在广汉郡、北面要地梓潼郡，以及南部、西部诸郡屯兵为兵源，设立西川军，大寨常设在眉山脚下，共募得六万余人，皆为百里挑一的健壮虎贲，益州降将张翼、冷苞、高沛、杨怀等均纳入军中效力。
广汉乃益州核心腹地，不容有失，刘琦又调文武双全的沮授来成都，既是任益州司农，重点推动新政改革，又兼任西川军监军一职，掌管军纪法度，以确保这支军队的纪律和忠诚。
士兵与副将乃至监管都已到位，西川军主将的人选却始终悬而未决，同时益州兵马都督的职位也一直空缺。
镇巴军统领甘宁军功能力均足够，但毕竟非本地出身，而益州各郡县乃至屯兵内部皆不乏暗流涌动，眼下刘琦虽然领益州牧，但未来的重心肯定会在荆州乃至中原，而不会留在处于大后方的蜀地，故益州除了由张松任长史主掌政务、沮授任司农推动改革外，还迫切需要一名够分量的人物出任兵马都督，以统领三军，震慑宵小。
此人既要威震三军，又要在本地颇有名望，才能弹压魑魅魍魉。刘琦思量许久，既听取庞统、诸葛亮、沮授等心腹谋士的意见，又与张松、法正等益州名士反复商定人选，最终一致认为除前益州护军黄权黄公衡外，再无他人足以胜任。
然此时黄权已只身回了阆中老家，在乡间草堂耕读度日，刘琦数次去书相邀，又派法正为使求访，皆被以年老气衰、不堪征战为由婉拒，最后只能由刘琦亲赴阆中，并摆足礼仪，多次登门拜见，留下三顾草堂的佳话。