筑基的功夫完成以后，也就是可以定、静，先天之体也成，此时就可以进入性命双修阶段，实际上就是采药、合真，也就是前面讲到的炼精化气、炼气化神、炼神合道的功夫。
和筑基期的气息在任督二脉中调动不同，从这一阶段开始，经脉中开始有了药，而气息成为药的载体，所以又称为转河车。
河车怎么回事前面讲过。钟吕认为河车起始于肾水中的真气，这里真气盈动下阴则动，此是气就由会阴穴经尾闾、夹脊一路向上过泥丸，下鹊桥，过重楼、绛宫到中丹田，与心脏离火相交，这就是钟吕所说的龙虎相交。当然，这条河车所走的路在筑基炼己时已经通了，不过因为这一阶段没有心神引动，所以还不是真正的转河车，只需要感觉到任督二脉就够了。
这一阶段的功夫，张三丰又和前辈们的有些不同，他是从脚底涌泉开始，上冲到膝，在佛教中也有类似的功夫，称为芦芽，感觉小腿内好像有小虫子向上钻的感觉，接着再慢慢向上到尾闾，再向上冲达到头顶泥丸宫，下面的就和传统的转河车相同了。
在河车开始转起来以后，就要有意识地逐渐加强对药的采运。前面详细讲过什么是药，铅、汞这些都是药。张三丰还用了一个特殊的名称，就是“一粒黍米”来指药。不论叫什么，采或运都必须先找到它才可以，就是先要在体内找到它。
如果说筑基是个关卡的话，采药同样也是一个关卡。如果说入定筑基只要功夫深了早晚总归能够做到，那么找到体内的药就不是下苦功就能达到的了，因为在混沌杳冥间去找到铅汞，说着容易做起来难，这就需要资质，或者说是仙根了。
如果说筑基就好像是在黑夜里寻找黑色的眼睛的话，那么采药就差不多相当于再多戴上副深色墨镜去找了。如果再给你加上时间限制的话，而且是极短暂的瞬间呢？所以在这一步就拦住了绝大多数修道人。
为了帮助大家完成采药的功夫，张三丰把采药的位置明确指了出来：“炼己持心、明理见性之时，攒簇发火，不出半刻时辰，立得黍米玄珠，现于曲江之上。”
在以前，这些都是门派口口相传的绝秘，绝大多数修道人都被卡在这里不得寸进。张三丰把这最关键的一点说出来就容易多了，只需要专注心神沿着小肠位置找，虽然元精出现的时候小如一粒黍米，但是它却通透明亮。在一片黑暗中突然出现一个小太阳，只要方向找对了，就算“真铅始生之时，其气迅速如电”，也不难捉住它，这就是加入门派，有个师傅的好处。找到药以后，只需要用心神引导它进入经脉中运转河车就可以了。
采了药以后，下一步就要准备炼药，但是炼药还需要保证原料供应充足，太少太弱就算勉强去炼也没有效果，所以在小周天炼药之前，多一个封存、温养的过程，或者说是一个锻炼药物的过程。在小周天元精运转过程中，到达泥丸宫的时候需要暂时停住，时间非常短，甚至不明显得根本感觉不到，这就是封固。
为什么说封固很短暂甚至感觉不到呢？因为此时的铅、汞实际上就是离火和坎水，既然有药生出了，水也好火也罢，水火都不等人，生出来就要动，否则它就会向四处蔓延。武侠小说里描写的走火入魔差不多就是这种状态，管不住水、火，结果就严重了，所以药生时小周天就已经运转了，带动着进入炼药阶段。
内丹功夫中周天的时间不是固定的，这不是说气息或元精在任督二脉里转一圈的时间，而是把整个修炼的时间按年、月、日、时等进行划分，这样就有了不同的周期。为什么要这么划分，实际上就是为了从小到大，把整个修炼过程与宇宙环境相适应，在恰当的时候做恰当的事，达到事半功倍的效果。比如以一刻的周天为例，上半刻是温，阳生，需要进阳火，下半刻则是凉，阴长，此时就需要退阴火。以一天为周天的话，就是子时到巳时进阳火，午时到亥时退阴火。如果对应到月周天的话就是上半月进阳火，下半月退阴火，对应年周天就是上半年进阳火，下半年退阴火。