小智的旅程回归正线！
与此同时，天上出现了一个圆盘飞行器
这个圆盘飞行器一直在橘子群岛附近的领空逡巡！
似乎在寻找着什么。
第二天，小智一行离开赫尔海姆，选择继续旅行，一步步的变强，直到最后可以打败这些异域者为止。
凭借神奇宝贝的天赋资质来获胜，算不上是训练家的本事，只有在一次次的战斗中让自己的神奇宝贝进化到最高，变成最强，才是神奇宝贝训练家的真意！
而小茂在知道小智离开之后并没有急着跟着离开，现在对他来说最重要的是摸清楚手上异域者的战斗技能和各种特性。
如果不趁现在空闲的时候把能力全部掌握，等到之后战斗的时候再临场发挥的话，那就太可悲了。
但与之相反的是，火箭队的两人一猫才刚刚对指挥异域者有了一点心得，在得知小智一行人离开之后，就立马跟了上去。
——
在这期间，上岛的不止他们几个，离岛的同样不止他们几个！
离开赫尔海姆岛屿的训练家们，带着抓到的异域者分散到世界各地！
全盛的神奇宝贝世界，各种各样有关于神奇宝贝的比赛遍地都是。
综合选美的，造型的，单一种群选美的……
战斗的，单一属性的对战比赛，甚至连单一种族的对战比赛都有。
随着带着异域者从赫尔海姆离开的训练家们活跃在各地的比赛场上时，这个世界第三次发现这些异域者的强大！
相较于前两次都只是通过电视屏幕看到，这一次能够直接在赛场上亲身感受到，更能让其他训练家有一个完整的概念。
而在面对这些异域者的那种强大的压迫，无敌的实力，越来越多的训练家开始向往和憧憬这种全新的神奇宝贝。
也因此前来交换捕捉球的人也越来越多！
甚至还出现了那种一整车一整车来交换的事例！
不同于普通的精灵球，每个训练家只能挂载6个，这些捕捉异域者的捕捉球没有携带上限！
只要你能带得下，你就算带上100个都没问题。
——
交换的人越来越多，收集任务剩下的图鉴名录也越来越少！
那些稀有的神奇宝贝也根本不容易抓到。
与其如此，易斯特暗地里调整了神奇宝贝的兑换规则！
那些已经兑换过的神奇宝贝，仍然还会继续收，但是兑换的比例则是经过调整的。
除了一个全新的族群最开始的是一公一母两只换一个异域者专用捕捉球之外，剩下的，五只健康的神奇宝贝换一只捕捉球！
这五只神奇宝贝，不管是不是同一个种类，只要凑够了五只都能用来兑换捕捉球！
……
同时，易斯特专门制造出一个分身坐镇道馆。
一边用来指挥战斗，一边制造更多异域者专用捕捉球。
而易斯特本人则是在解放之后，开始主动寻找这个世界的神兽！
第一个版本的急冻鸟，闪电鸟，火焰鸟！
凤王，水君，雷公，炎帝，海神洛奇亚！
梦幻，超梦，时拉比等！
另外还有大地之神固拉多，天空之神裂空座，时间之神与空间之神等。