通过前面的介绍不难看出，司马承祯对老庄思想有着极为精深的见解，特别是对损己思想理解更为深刻，他甚至把“损己”作为修仙理论的根本思想，这无疑是对重玄思想的一种发展。
这里需要简单解释一下什么是损己。损有损害、减少等意思，损已当然不是要损害自己，而是要去除自身存在的那些对修道有影响的东西，比如前面讲到的七情六欲、贪嗔痴恨之类的情绪，内心对权利、财色、虚名等外物的追求等等，把这些影响修行的东西从自己的周围、身上、体内、心内损去，以便轻装上阵，一身无所羁绊地修炼去也。反正你要带着这些东西是不可能修成正果的，所以损己的思想就要提升到相当高度才可以的。
司马承祯当年被唐睿宗召见时，就曾经非常明确地对睿宗说：“道经之旨，为道日损，损之又损，以至于无为。且心目所知见者，每损之尚未能已，岂复攻乎异端，而增其智虑哉！”下面简单从原因、对象和方法这三个方面说说司马承祯的损己思想。
一是损己的原因、目的，就是为什么要损己。本质上，道士们所做的一切，都可以归根于长生、成仙，最少也是想活个千八百岁吧，当然排除那些失去了向道之心的酒肉道士了，这其实也是道教所追求的终级目标。
这里需要提一下，道教在不同的发展阶段，对神仙的定义却有很大区别，司马承祯的追求自然是得道飞升，在他的心目中神仙却是有两种的，一种是“人生时禀得虚所，精明通悟，学无滞塞，则谓之神。宅神于内，遗照于外，自然异于俗人，则谓之神仙，故神仙亦人也。”这是明显是得自上清一脉的传承，是典型的《黄庭经》里面的观点。
他认为还有另一种神仙的存在，那就是“神性虚融，体无变灭，形与道同，故无生死，隐则形同于神，显则神同于气，所以蹈水而无害，对日月而无影，存亡在己，出入无间”，这又是脱胎于庄子的“真人”，显然，在司马承祯眼中，老庄是不能否定的，还需要我辈继续研究学习领会继承的。
仔细研究上面两种神仙不难发现其中的区别，这显然能解释为什么司马承祯能接受有两种神仙存在的原因，前一种神仙是保持自然真性的，是一种超脱了的凡人，虽然是神仙，但本质上还是凡人。第二种神仙则是等同于经过坐忘七个境界修行而成，损己而与道相合，最终是超脱了凡人的存在，也就是说那种没有了凡人的一切特征的人，自然已经不再是凡人了，这就是司马承祯损己所追求的理想中的神仙。
第二是要损什么，损的对象是什么。损己是为了成仙，那么哪些要损去，哪些不能损去就得心中有数，别损了不该损的就杯具了。按照司马道长的说法，要损去的东西还真不少，比如七邪情，就是喜怒哀乐爱恶欲，八邪气，就是风寒暑湿饥饱劳逸，当然这些都是俗事之缘，其他还有很多，比如庆祝、吊唁、升迁、酒局等等，“去此邪成仙功也”，就不一一列举了。
第三是怎么损，用什么方法来损己呢。为什么要损，损什么的问题解决了，下面就是怎么操作的问题了，这些实际上前面已经讲到了，主要就是断缘、收心、简事，最重要的就是要去除心垢，损去外物简单，难就难在如何收心。
以上就是司马承祯的损己思想，至七阶坐忘功法大成，这一思想也臻于圆满。
前面还讲到了司马承祯的五渐门的修行问题，这是他早期总结出来的修道理论，这里再简单讲一下。
司马承祯在《天地宫府图序》中讲到：“气元冲始，乘运化而分形”，《服气精义论》中说：“夫气者，道之畿微也……”，由此可以看出，他在早期就一直很重视老庄思想的研究，在摸索服气，也就是修行的法门。他在这里所讲的气是由道产生的，而道是运动的，变化的，它可以化生万物，元气又是物质的、精神的本元，这些理论显然是源自老子的思想。
在此基础上，司马承祯认为贵生就是要养生延寿。道生万物，元气自然也是来自道，贵气就是重视精神对气的统率，说白了就是要重视对气的修炼，这些理论明显不同于葛洪那类传统的外丹法了，所以说司马承祯推动着外丹修炼向内丹修炼的转变，进而提出了内丹修炼追求仙道的思路。