李西月有好几部着作都涉及了内丹功法，而且有不同的阶段划分，所以初看起来有些乱，体系貌似也不是很清晰，实际上如果按照后天、先天这两大阶段分析的话，条理就会清晰很多了。
这里可以先简单为道友们整理一下西派的功法划分：首先是先划分成后天和先天两大阶段。进一步，把后天分为后天和后天中之先天，先天则分为先天和先天中之先天，前面已经讲到过了。
上面讲的一些概念和基础，有些是属于某个阶段的，有些则是贯穿整个修炼过程的。比如河车，《三车秘旨》中讲到的第一件河车，就是上面讲到的运气的功夫，这就是整个后天阶段的功夫。第二件河车，就是运精功夫是先天阶段中的先天的功夫，第三件河车则是先天阶段的先天中之先天阶段的功夫。再比如《道窍谈》中讲到的开关、炼己和养己，是后天阶段的功夫，而炼精、炼气、炼神了性、炼神了命和炼神还虚则是先天阶段的功夫。李西月有一部《收心法》前面没有讲到过，里面有三种收心的功夫，这又是入手的功夫，属于后天初期。还有《后天串述文终经》中讲了九层的功夫，包括收心、寻气、凝神、开关、展窍、筑基、得药、结丹和炼己，这又是整个后天阶段的功夫了，是对后天阶段的更细致的划分。所以，如果从大到小划分清晰以后，无论他有多少概念，如何对修炼阶段划分，都可以清楚地理顺出来。
由此可见，李西月的内丹修炼的功夫的体系还是很清晰的，只不过各阶段划分得更细致，划分的角度有所不同，所以看起来有些乱罢了。当然，如果和传统的筑基、炼精化气、炼气化神、炼神化虚和炼虚合道的划分来对应的话，其实就是增加了筑基前的一些功夫，差不多就是增加了《后天串述文终经》中所讲的那九层功夫中的筑基之前的五步，这又从侧面说明了李西月极为重视性功阶段，对性的认识有很大进步。
九层炼心是对整个修炼过程的划分，也就是说从第一层开始，就是磨炼心性的入手功夫，到最后一层完成九层炼心，就是得道成仙了。其中前六层是后天的功夫，而后三层是先天的功夫，之所以后天功夫如此细致，又说明了他重视后天功夫的修炼。
需要提前说明一下，李西月的丹法中，主要是在划分和细节上的突破，总体上还是延续了前辈们的丹法，比如九层烧心就是继承了柳华阳的《慧命经》，后面会讲到，这是龙门派的丹道。同时，李西月的练功五关也是在清修派的炼精化气，炼气化神，炼神还虚的基础上发展出来的。所以，李西月的丹法受孙道鸾、钟吕、陈抟、张三丰、陆西星、李道纯、白玉蟾等很多前人的影响，可以说是博采众长的产物。
直接看李西月的九层炼心还是比较困难的，所幸有人做过注解，这里参考西派四传弟子魏尧的《一贯天机直讲》，简单给道友们讲一讲，顺便把李西月的阴阳双修理论理一下。魏尧曾经在北京举办讲座，期间就曾经把九层炼心的要诀透露了很多，这里就是参考他的讲解。
初层炼心：炼的是未纯之心，就是炼己。我们这些凡尘俗世中人的心，遭受着贪嗔痴，求不得，怨憎会，爱别离，种种毒打，这些全都是炼心的阻碍。怎么办？法在止观，止于身中虚空并内视。具体在哪里呢？“脐堂之后，命门之前，其中稍下，有一个虚无的圈子”，有人说这里就是下丹田，有人说中丹田也差不多在这，总之就是心照空中，与气相守，炼心养性。等到那些影响心的外界干扰没了，就清净元基坚固了，就有一线心光和一缕真气相接，什么也不想就对了。
李西月在这里提到了止观，止是止念，观是观心，本是佛家的词，这里就是指性命双修。那么为什么用止观，而不用性命双修呢？当然不仅仅是说明自己是三教合修的这么简单。佛教中止观有很多种，很多层次，如小止观、大乘止观、天人止观等，是止念观空，从空中下手的，从小止观的知止，到大乘止观的自然无为，不得不承认，佛家的止观是炼心的最佳功法，正是因此，李西月才用止观这个概念。
第一层是入手的功夫，最终能够心息相依，心合于息，这是要领，功夫日深，就可以心息送进那个虚无的圈子里，形成一个玄窍，这就是李西月所说的那个后天中之先天，此时的息可以称为真息，而合在其中的神就是意，而且是一种无意之意，不能有意而为之，而这一个点就是由定入忘的转变。此后就进入第二层炼心了，如果不能达到忘的境界，反而刻意去维持这种定的状态，反而会出现类似于武侠小说里面那种走火入魔的现象。
二层炼心：炼的是入定之心，是合气的功夫。西派的功法挺有意思的，他们有一个观点，就是说体内的丹田只有结丹后才是丹田，结丹前最多就是个田。比如田地，里面种了水稻叫稻田、种了小麦就是麦田，如果长的全是草，那么只能叫草田，丹田也一样，有了内丹才能称它为丹田。之所以要这么说明，是因为西派并不认为丹田特殊，它和其他窍穴本质上是一样的，都是“黄庭一路”。黄庭一路，皆为玄关，当然对于玄关的概念，西派讲得又相当深入了，这里不展开。
那么这一层的功夫是怎么样的呢，因为是炼入定之心，就是拿第一层定下来的心当对象修炼，最终让心定于气中。实际上就是上面所说的，反复心息相依，由定的状态达到忘的状态，最后心定在脐下丹田之中，此时才可以发现丹田玄关，丹原即成。
三层炼心：炼的是来复之心，是炼气的功夫。从忘境丹原初成，玄关既现，此时就可以采药了。
上面讲过，玄关一窍是西派一个相当重要的秘诀，不会轻易示人的。那么什么是玄关？李西月说玄关有两种，一种是活的，一种是死的，死的其实就是固定的，不变的，分别在黄庭、气穴和丹田三处。活的则就不一定了，是随着凝视聚气的功夫才出现的。
李西月的死活玄关的说法，有些人认为是一大创新，实际上这种死活的说法可能是创新，但玄关的固定还是不固定，早在《黄庭经》中就提到过。
这一层的关键就是精气神三宝合而不分，否则是不能采药的。有药以后就是河车搬运了，这一点和以前讲过的是一致的，这一层的河车就是李西月讲的小周天运气的那个河车。由于破身之后的人阴气非常重了，阳气达不到一定强度是感受不到的，也就谈不上转河车采药，因此西派同样讲究活子时、活午时修炼。活子时是一阳初生，可能开始时感受不到，但是必须要利用外界的阳气来辅助阴跷中的先天真阳转起来。活午时阳气转衰，一阴初生，就知觉而言，感受是逐渐变弱，此时就要注意在定和忘上面下功夫了。
四层炼心：炼的是退藏之心，是得气的功夫。这一层也称为七返功夫，就是上一层活子时运功，从阴跷吸入外阳后，阳气上冲心府。道友可能奇怪，不是应该沿督脉向上吗？注意，这是在修道、修仙，当然是逆才行嘛。
阳气到顶之后，注意用忘字的功夫，意守泥丸，此时阳气可以化液，意守黄庭、元海，引导它向下直到丹田，与肾水相交，这就叫七返小周天，同样是小周天的河车功夫。