林兆恩说，现在的儒家支离，道家沉迷在炼精化气那套，佛教只看重空、忘，是三教有问题吗？并不是，而是三教的后人出了问题，没有理解圣人们的本意。“非三教也者，非以非三教也，以非三教之流者也”，三教的道是相同的，无非就是追求本心本性，恢复本来纯净无垢的心性。三教的圣人所传下来的道，也都是为了让后人能够发现本心，明白本自圆成、自然清净的道理。“教本于道，道本于性，余于是而知能性吾之性以为性，则孔、老、释之道可得而道。”
还是回到本章开头的问题上，之所以后人对三一教的定位有分歧，主要是林兆恩在儒家思想的基础上将三教统一在德性伦理上，以全善之德为人性的内在规范涤炼自心，认为这就是儒家立本，道教入门，佛教极则的功夫，而三者又是以立本，即人道为前提的。下面要讲三一教的重要典籍《九序心法》，同样体现了入门必须先要学怎么做人，三纲五常是最低标准吧，所以，林兆恩还是偏重于儒家的。
三教合一一直在讲，从唐代以前道教主张三教同源，但是大家都是喊喊口号，没有把它当作一个严谨的课题去专心做，也没有人踏下心来把这套理论研究透了。林教主说了，三一教就是以儒家的人伦纲常，对，就是统治阶级喜欢的这个作为了立教的成人之本，道教的那些法术、功法等等就是修身养性之本，仔细体会感悟佛教的空就是证得大道之本，三者都是根本，缺一不可。
由于三一教这种三教合一的原因，他的科仪、信仰、修炼等都具有道教的特性，不过一直有学者提出三一教还只能算是民间信仰，还谈不上是道教。
林兆恩认为三教实际上是一样的，只不过是表现不同罢了，“统而同之，合而一之”，三教“同归于无名，返于无始”，所以三一教才能够同时传三教的道统，成立了“三教先生”教团，由此才被传统儒家所排斥。
比如黄宗羲就很瞧不起地说林兆恩搞的那套东西本来就是和尚、道士的东西，却怕别人说他，便用儒学加以包装，最终却弄成了非驴非马，外国人称为骡子，可悲啊。
另外，林兆恩这套东西有宗教的性质，但是也不被一些道门人士接受，甚至给了一个“邪”字。
再次证明了不明确站队的骑墙派是两头不讨好的。
上一章提及了，林兆恩在世时是比较反感道教那些玄之又玄的东西的，之所以三一教越来越像道教了，主要还是因为弟子们的功劳。也就是说，林兆恩对于道教是有着很多不认可，甚至否定的地方的。林兆恩常给门下弟子们讲过自己的过往历史，曾经讲过他第四次省试失败后，想改学道教，练练那着名的性命学，并且花了十几年遍访名师，可惜一无所获。
三一教嘛，自然对三教都有很精深地研究才可以。在林兆恩看来，黄老是道家的根本，是本源，其他的则全是异端。什么意思呢，就是说从古至今，如果是建立在黄老之学上的道派、理论、思想都没问题，其他的都是欺世盗名。
在林兆恩看来，除了黄老以外，后世可以勉强是研究真正道教学问的最有名的首推庄子，再往后魏伯阳、钟离权、许旌阳、司马承祯、吕洞宾、白玉蟾、张三丰等等吧，这些位还算可以，没有走上邪路，多少还研究了些黄老的学问，研究的是真正的道教学问。除了庄子以外，林兆恩最赞赏的是许旌阳，因为他开创的是净明道。净明道前面讲过了，这是一个更加倡导忠孝思想的教派，而从这方面切入，把儒和道联系起来非常中顺滑、自然。
这么看来，道教在林教主心目中还是有些位置的，不过两千年下来能入他的法眼的高道也没过两手之数。
除此之外，林兆恩对道教发展出来的各大门派、流派也表示了否定。他说，道教可以说是一分三支，就是清净、彼家和炉火。注意，这并不是他在创新，实际上清净就是指的清修派、彼家指的双修派、而炉火自然就是炼外丹的那伙人了。清净派自然是好的，可以代表黄老一脉正统。而另两家就不怎么样了，特别是阴阳双修，简直就是打着修炼内丹的幌子行淫秽之事。当然了，那些玩火炼丹的也不咋滴，无非就是为了骗钱罢了，更可气的是还毒死了那么多人。
之所以对道教有这么多偏见，其实和林兆恩生活的时代有着重要关系。早年，正好是嘉靖皇帝统治时期，前面也重点讲过那段时期的道教，还讲过邵元节和陶仲文，那是一个从全国最大的boss到民间百姓都疯狂迷信道教的时代，莆田怎么可能不受影响？能够在那个时代冷眼看世界的人并不少，林兆恩绝对是其中之一。
简单归纳一下，林兆恩对道教主要有四个方面的意见：
首先，道教那种出世的思想要不得，绝对要不得，因为这是完全违背了儒家的入世思想，也不是统治阶级喜欢看到的。“抛世然后可以学道”，跑到深山老林里自己修仙去了，谁种地？谁交粮上税？都不给皇帝生孩子了，国家怎么办？这种没有社会责任心的避世思想是不能有的。
其次，道教那一套修仙、长生、神怪之类的东西太迷信了，谁见过长生不老的，谁见过有人能飞天遁地？儒家倡导的宿命论，命由天定，你们这些道士非要逆天而行，超越天命，那怎么可能。想想你们老祖黄帝、老子，一个活了111岁，一个活了九十多岁，他们都不能长生，你瞎吹什么呢？当然了，道教有些养生的学问还是有点用的。
还有就是人伦问题，道士们抛家弃子，跑进道观里清修去了，这完全是挑战三纲五常嘛。还是拿黄帝举例子，据历史记载，黄帝有四个老婆，生了25个儿子，老子也同样有儿子，还是魏国的相爷。你们道教的老祖都遵守人伦大道，你们这样做怎么算是真正的道士呢？“一阴一阳之谓道，而道则莫大于三纲”，道家不是讲阴阳平衡吗，为什么行动起来就不讲究了呢？由三纲来统摄仙道，这样才是正确姿势。
最后一点是道家所谓的“顺成人，逆成仙”更是胡说，特别是陈抟搞出来那个无极图以后，各种行功运气的功法层出不穷，岂不知老子的“道法自然”，气要遵循自然规律，你想逆着来就逆着来，是老祖教的吗？当然了，除此以外，林兆恩对陈抟的思想还是很推崇的。
个人感觉，非要明确林兆恩和三一教是儒还是道，得把他生前和死后分开来看，这样应该就比较容易一些了。