同之前马尼拉的舰队不一样，或许是因为距离太远的缘故，巴达维亚的联军舰队并不能确定对方什么时候起航，什么时候会来，因此多数情况下就将舰队集中在港口附近，并外出一二十里的距离上派遣一些巡航船展开巡逻。当西班牙人与南洋海盗的船队撤退下来之后，港口附近的海上力量也陡然增加了不少。
云集在港口中的主力舰就多达三十艘，此外还包括六十艘上下吨位还算凑合，至少超过千料规模的武装商船，并不算大的普通帆船的规模也达到了二百余艘之多，虽然在菲律宾一带的海域遭遇到了不少伤亡损失，可是在巴达维亚一带完成了和规模不小的荷兰舰队汇合之后，海上的兵力还是达到了两万五千人左右的规模，并拥有七万吨左右的军舰与武装商船。之前的时候因为情报渠道有限的缘故巴达维亚一带的荷兰总督并不了解东方人现在海上有可能的家底，当初加来海战之后虽然各船都针对性的做了很多的准备，可还是心中没有太大的底子。
撤退过来的西班牙人所说的话巴达维亚的总督并没有全信，不过对方船只上的那些破损之处来看，对方的海战火器确实存在很大的问题。即便如此，巴达维亚总督还是决定以防守战略为主，当敌军的船队来袭之后再同对方展开决战。毕竟在防守自己已有利益的情况下船员们所能挥出来的表现其实总是要比主动性的行动要多一些的。毕竟那些强敌的船队可不是携带有不少金银货物的货船。
好在因为西班牙舰队撤退下来之后威胁临近的缘故，船上的战备还算凑合，因此当敌船在海天之间出现之后不到半个小时之内各船就纷纷升起了帆并做好了作战的准备，海战的临时指挥权也由拥有主场优势而且实力更强的荷兰人负责。
虽然在以前的时候新教与天主教两家势力矛盾重重，不过在面临前所未有的强敌的时候，也不得不集兵在一起作战了。撤退下来的那些西班牙与南洋海盗们似乎还算乐观的情绪也感染了不少人，特别是舰到对方的船只的确是如传说中的那样因为重视防护而航速方面有很多短板，虽然在临近夏季的巴达维亚一带风向也不是特别有利，不过对于海上航行和在旗语之下的组织作战并不陌生的两家舰队来说还是很快形成了有效的协同并从多个方向向目标逼近而去。
在双方船队之间的距离逼近到大概两里左右距离的时候，还是先由联军舰队一方先开炮击。虽然即便在风浪并不算大的情况下在这个距离上展开炮击的效果可疑，但毫无疑问对己方的士气是有很大好处的，似乎仍然在宣称这一次作战的主动权乃至谁处于完全被动的一方。
吸取了之前在马尼拉附近海域上交战的经验教训，这一次为了防止那些线膛炮带来的威胁，船上不少炮位附近也都勇用粮袋或沙袋做了补充性的防护，并且在火力展开的时候，炮手以外的人员也大多蜷缩身子避免伤亡。据说那些东方强敌的炮火虽然对船体的杀伤力不大，可最重要的却是对人员的杀伤。