公元2332年，根据计划，国权同盟开始了一项人类有史以来最残酷的行动：基因净化。这个大毁灭式的屠杀计划是各国政府面对基因变种和被改造的人类最后的净化手段。国盟的部队扫荡了地球上每一个国家，逮捕了基因异变者、抗议激进分子、接受人工改造和人造机械器官移植的人类、网络犯罪者、嗑药者、转基因研究者以及各种各样他们认为会威胁人类自然发展的罪犯。这场全球都难以躲避的残暴行为，导致了上亿人丧命或被捕。同时，媒体被国盟严格控制，禁止报道这项计划的真相和实施过程，让全球大多数人并不完全了解大净化的疯狂和残酷。
当然国盟除了残暴的清理计划，也推进了很多其他领域科技技术的进步。许多过去因为各种原因，陷入停滞的重大研究项目被加速推进实施。在全新的时代需求下，人类攻克休眠仓技术和初级跃迁引擎技术，让人类终于可以漫步于星系之间。在全新的动力技术支持下，人类搭建了地面与近太空的传送通道，大型战舰、运输机可以直接在太空建造成为可能。随着各类大型战舰的建成，人类终于可以实现大批量移民至太阳系其他行星，加速开发新的殖民星球的同时，也缓解了地球过量的人口压力。
在这个时代里，一位名叫克里的科学家，开始制定计划，希望让自己的势力在国盟里面获得扩张。由于他没有受到大净化计划的干扰，克里得以全身心地投入于开发太阳系外星系的研究，目的是开发其它星系的矿产资源和外星系殖民。在克里的计划进行下，利用跃迁引擎技术而制造出的小型探测器，在太阳系外发现的新型矿产和高密度能源燃料让他在地球上声望大幅提高，并且获得了各方财团的巨额投资。靠着高度的支持和幸运，克里很快就获得了国盟的授权，拥有了数以千万计的犯人作为可支配对象。
这些犯人因为大净化计划而被捕，大部分都即将要被处死，犯人被送到克里的实验室中，进行筛选。克里计划要从这些犯人中，选出特异的机体，在太阳系外建立殖民地。他让手下挑选出40万人来进行休眠的训练和准备，同时也把这些特异人群的基因现状、基因突变状况详细建档立卡，录入超级电脑系统中。并设计了专门的智能系统，来管理和分析这些数据。智能管理系统通过筛选对比推测，同时试图预测出哪些机体可以在未来严酷的环境中生存。
通过智能系统的预判，只有四分之一的犯人能够在太阳系外的环境中求生。筛选出的10万人被送上了刚刚完工的四艘超大型深空勘探战舰，进入休眠状态。四艘超级战舰载着足够的补给、粮食、外骨骼战甲和电子系统，准备在他们抵达目的地的时候，给他们足够的资源得以生存。当导航系统设置完毕，目的地瞄准了遥远的艾尼赫兹星系，一切看起来都那么顺利，即使连克里都无法预料到，这些犯人正驶向银河系的边缘，准备面对即将到来的死亡。